На днях забился /. Напрочь, оставив лишь 5% для рута. Исследование показало, что в /usr/portage/distfiles накопилось три с половиной гига исходников. После на удивление долгого поиска в интернете нашёл упоминание утилиты eclean из пакета gentoolkit. Она как раз удаляет ненужные исходники, оставляя актуальные. Занес в кронтаб строки:

# воскресная чистка /usr/portage/distfiles
00 9 * * 0 /usr/bin/eclean distfiles --quiet